명왕계획 제오라이머 세상은 하우 드래곤(철갑룡)이라는 비밀 조직에 의해 지배되고 있었다. 주인공 아키츠 마사토는 어느날 하우 드래곤에게 맞서는 라스트 가디언이라는 조직에 납치되고, 하무로 미쿠라는 소녀와 함께 하우 드래곤의 팔괘로보에 대항하기 위한 최고의 메카, 하늘의 제오라이머의 조종사가 된다. 하늘의 제오라이머는 차원연결 시스템이 장착되어 다른 차원의 에너지를 마구 흡수하고, 공간폭격, 그리고 엄청난 에너지를 방출해 주위의 모든 것을 원자분해 해버리는 명왕 공격을 사용하는 무서운 기체. 마사토는 제오라이머에 탈 때마다 제 2의 인격, 그의 창조주인…